DF: РНК, обычно получаемая путем транскрипции из клонированной ДНК, которая дополняет специфическую мРНК или ДНК и обычно используется для исследования генов вируса, распределения специфической РНК в тканях и клетках, интеграции вирусной ДНК в геномы, транскрипции и т. д. Тогда как ДНК-зонды являются предпочтительными. Для использования на более макроскопическом уровне для обнаружения присутствия ДНК/РНК конкретных видов или подвидов для генетических исследований предпочтительны зонды РНК.