(1) lasten migreeni, johon liittyy kohtauskohtaista vatsakipua. Tämä on erotettava samankaltaisista oireista, jotka vaativat leikkausta. (2) sairaus, joka aiheuttaa ajoittaista vatsakipua ja jonka uskotaan liittyvän migreeniin; vatsan migreenillä on joitain migreenin piirteitä, esim. suvussa voi olla voimakasta migreenipäänsärkyä, ja tilaa voi helpottaa uni; päänsärkyä ei kuitenkaan välttämättä ole. Diagnoosi riippuu muiden vatsakipujen syiden sulkemisesta pois.