(1) paroksismal karın ağrısının eşlik ettiği çocuklarda migren. Bu durum cerrahi müdahale gerektiren benzer semptomlardan ayırt edilmelidir. (2) aralıklı karın ağrısına neden olan ve migrenle ilişkili olduğuna inanılan bir bozukluk; karın migreni migrenin bazı özelliklerini taşır; örneğin, ailede güçlü bir migren baş ağrısı öyküsü olabilir ve bu durum uykuyla rahatlayabilir; ancak baş ağrısı mevcut olmayabilir. Tanı karın ağrısına neden olan diğer nedenlerin dışlanmasına bağlıdır.