Bir proteindeki bir veya daha fazla amino asidin bir başkasıyla doğal olarak meydana gelen veya deneysel olarak indüklenen yer değiştirmesi. İşlevsel olarak eşdeğer bir amino asit ikame edilirse, protein vahşi tip aktiviteyi koruyabilir. İkame ayrıca protein fonksiyonunu azaltabilir veya ortadan kaldırabilir. Deneysel olarak indüklenen ikame, genellikle enzim aktivitelerini ve bağlanma yeri özelliklerini incelemek için kullanılır.