La sustitución natural o inducida experimentalmente de uno o más aminoácidos de una proteína por otra. Si se sustituye un aminoácido funcionalmente equivalente, la proteína puede retener la actividad de tipo salvaje. La sustitución también puede disminuir o eliminar la función de la proteína. La sustitución inducida experimentalmente se usa a menudo para estudiar las actividades enzimáticas y las propiedades del sitio de unión.