Естествено възникваща или експериментално индуцирана замяна на една или повече аминокиселини в протеин с друга. Ако се замести функционално еквивалентна аминокиселина, протеинът може да запази активност от див тип. Заместването може също да намали или елиминира протеиновата функция. Експериментално индуцираното заместване често се използва за изследване на ензимните активности и свойствата на мястото на свързване.