DF: РНК, обикновено приготвена чрез транскрипция от клонирана ДНК, която допълва специфична иРНК или ДНК и обикновено се използва за изследвания на вирусни гени, разпределение на специфична РНК в тъкани и клетки, интегриране на вирусна ДНК в геноми, транскрипция и т.н. Докато ДНК сондите са предпочитани за използване на по-макроскопично ниво за откриване на наличието на ДНК/РНК от специфични видове или подвидове, РНК сондите са предпочитани за генетични изследвания.