DF: RNA zwykle otrzymywany poprzez transkrypcję ze sklonowanego DNA, który uzupełnia specyficzny mRNA lub DNA i jest powszechnie stosowany do badań genów wirusa, dystrybucji specyficznego RNA w tkankach i komórkach, integracji wirusowego DNA z genomami, transkrypcji itp. Preferowane są natomiast sondy DNA do stosowania na bardziej makroskopowym poziomie do wykrywania obecności DNA/RNA z określonych gatunków lub podgatunków, do badań genetycznych preferowane są sondy RNA.