DF: RNA, die normalerweise durch Transkription aus geklonter DNA hergestellt wird, die eine spezifische mRNA oder DNA ergänzt und im Allgemeinen für Untersuchungen von Virusgenen, der Verteilung spezifischer RNA in Geweben und Zellen, der Integration viraler DNA in Genomen, der Transkription usw. verwendet wird. DNA-Sonden werden hingegen bevorzugt Für den Einsatz auf einer makroskopischeren Ebene zum Nachweis des Vorhandenseins von DNA/RNA bestimmter Arten oder Unterarten werden RNA-Sonden für genetische Studien bevorzugt.